data_PB ############################# # Protein Blocks Annotation # ############################# ####################################################################################### # PB encoding by Protein Blocks Expert 2.0 server (http://www.bo-protscience.fr/pbe/) # # Reference: Biophys Rev. 2010 Aug;2(3):137-147. Epub 2010 Aug 5. # # : Nucleic Acids Res. 2006 Jul 1;34(Web Server issue):W119-23. # ####################################################################################### save_PB_annotation_1 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 1 _PB_list.Query_ID db1xy8_1425#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1xy8.ent _PB_list.Output_file_name bmr6425_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr6425_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code YCKFEXXTFXSC _PB_list.PB_seq_code zzjbfklmcezz _PB_list.PDB_ID 1XY8 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "Torsion angle dynamics" _PB_list.Entry_ID 6425 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 TYR 1 A . 1 TYR . 1 6425 1 1 1 1 2 CYS 1 A . 2 CYS . 1 6425 1 1 1 1 3 LYS 1 A . 3 LYS j 1 6425 1 1 1 1 4 PHE 1 A . 4 PHE b 1 6425 1 1 1 1 5 GLU 1 A . 5 GLU f 1 6425 1 1 1 1 6 DTR 1 A . 6 DTR k 1 6425 1 1 1 1 7 IAM 1 A . 7 IAM l 1 6425 1 1 1 1 8 THR 1 A . 8 THR m 1 6425 1 1 1 1 9 PHE 1 A . 9 PHE c 1 6425 1 1 1 1 10 HHK 1 A . 10 HHK e 1 6425 1 1 1 1 11 SER 1 A . 11 SER . 1 6425 1 1 1 1 12 CYS 1 A . 12 CYS . 1 6425 1 stop_ save_ save_PB_annotation_2 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 2 _PB_list.Query_ID db1xy8_1425#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1xy8.ent _PB_list.Output_file_name bmr6425_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr6425_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code YCKFEXXTFXSC _PB_list.PB_seq_code zzlafklcnbzz _PB_list.PDB_ID 1XY8 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "Torsion angle dynamics" _PB_list.Entry_ID 6425 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 TYR 2 A . 1 TYR . 1 6425 2 1 1 1 2 CYS 2 A . 2 CYS . 1 6425 2 1 1 1 3 LYS 2 A . 3 LYS l 1 6425 2 1 1 1 4 PHE 2 A . 4 PHE a 1 6425 2 1 1 1 5 GLU 2 A . 5 GLU f 1 6425 2 1 1 1 6 DTR 2 A . 6 DTR k 1 6425 2 1 1 1 7 IAM 2 A . 7 IAM l 1 6425 2 1 1 1 8 THR 2 A . 8 THR c 1 6425 2 1 1 1 9 PHE 2 A . 9 PHE n 1 6425 2 1 1 1 10 HHK 2 A . 10 HHK b 1 6425 2 1 1 1 11 SER 2 A . 11 SER . 1 6425 2 1 1 1 12 CYS 2 A . 12 CYS . 1 6425 2 stop_ save_ save_PB_annotation_3 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 3 _PB_list.Query_ID db1xy8_1425#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1xy8.ent _PB_list.Output_file_name bmr6425_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr6425_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code YCKFEXXTFXSC _PB_list.PB_seq_code zzlafklcnbzz _PB_list.PDB_ID 1XY8 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "Torsion angle dynamics" _PB_list.Entry_ID 6425 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 TYR 3 A . 1 TYR . 1 6425 3 1 1 1 2 CYS 3 A . 2 CYS . 1 6425 3 1 1 1 3 LYS 3 A . 3 LYS l 1 6425 3 1 1 1 4 PHE 3 A . 4 PHE a 1 6425 3 1 1 1 5 GLU 3 A . 5 GLU f 1 6425 3 1 1 1 6 DTR 3 A . 6 DTR k 1 6425 3 1 1 1 7 IAM 3 A . 7 IAM l 1 6425 3 1 1 1 8 THR 3 A . 8 THR c 1 6425 3 1 1 1 9 PHE 3 A . 9 PHE n 1 6425 3 1 1 1 10 HHK 3 A . 10 HHK b 1 6425 3 1 1 1 11 SER 3 A . 11 SER . 1 6425 3 1 1 1 12 CYS 3 A . 12 CYS . 1 6425 3 stop_ save_ save_PB_annotation_4 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 4 _PB_list.Query_ID db1xy8_1425#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1xy8.ent _PB_list.Output_file_name bmr6425_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr6425_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code YCKFEXXTFXSC _PB_list.PB_seq_code zzjbfklmcezz _PB_list.PDB_ID 1XY8 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "Torsion angle dynamics" _PB_list.Entry_ID 6425 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 TYR 4 A . 1 TYR . 1 6425 4 1 1 1 2 CYS 4 A . 2 CYS . 1 6425 4 1 1 1 3 LYS 4 A . 3 LYS j 1 6425 4 1 1 1 4 PHE 4 A . 4 PHE b 1 6425 4 1 1 1 5 GLU 4 A . 5 GLU f 1 6425 4 1 1 1 6 DTR 4 A . 6 DTR k 1 6425 4 1 1 1 7 IAM 4 A . 7 IAM l 1 6425 4 1 1 1 8 THR 4 A . 8 THR m 1 6425 4 1 1 1 9 PHE 4 A . 9 PHE c 1 6425 4 1 1 1 10 HHK 4 A . 10 HHK e 1 6425 4 1 1 1 11 SER 4 A . 11 SER . 1 6425 4 1 1 1 12 CYS 4 A . 12 CYS . 1 6425 4 stop_ save_ save_PB_annotation_5 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 5 _PB_list.Query_ID db1xy8_1425#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1xy8.ent _PB_list.Output_file_name bmr6425_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr6425_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code YCKFEXXTFXSC _PB_list.PB_seq_code zzjbfklcnezz _PB_list.PDB_ID 1XY8 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "Torsion angle dynamics" _PB_list.Entry_ID 6425 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 TYR 5 A . 1 TYR . 1 6425 5 1 1 1 2 CYS 5 A . 2 CYS . 1 6425 5 1 1 1 3 LYS 5 A . 3 LYS j 1 6425 5 1 1 1 4 PHE 5 A . 4 PHE b 1 6425 5 1 1 1 5 GLU 5 A . 5 GLU f 1 6425 5 1 1 1 6 DTR 5 A . 6 DTR k 1 6425 5 1 1 1 7 IAM 5 A . 7 IAM l 1 6425 5 1 1 1 8 THR 5 A . 8 THR c 1 6425 5 1 1 1 9 PHE 5 A . 9 PHE n 1 6425 5 1 1 1 10 HHK 5 A . 10 HHK e 1 6425 5 1 1 1 11 SER 5 A . 11 SER . 1 6425 5 1 1 1 12 CYS 5 A . 12 CYS . 1 6425 5 stop_ save_ save_PB_annotation_6 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 6 _PB_list.Query_ID db1xy8_1425#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1xy8.ent _PB_list.Output_file_name bmr6425_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr6425_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code YCKFEXXTFXSC _PB_list.PB_seq_code zznojmlmnozz _PB_list.PDB_ID 1XY8 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "Torsion angle dynamics" _PB_list.Entry_ID 6425 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 TYR 6 A . 1 TYR . 1 6425 6 1 1 1 2 CYS 6 A . 2 CYS . 1 6425 6 1 1 1 3 LYS 6 A . 3 LYS n 1 6425 6 1 1 1 4 PHE 6 A . 4 PHE o 1 6425 6 1 1 1 5 GLU 6 A . 5 GLU j 1 6425 6 1 1 1 6 DTR 6 A . 6 DTR m 1 6425 6 1 1 1 7 IAM 6 A . 7 IAM l 1 6425 6 1 1 1 8 THR 6 A . 8 THR m 1 6425 6 1 1 1 9 PHE 6 A . 9 PHE n 1 6425 6 1 1 1 10 HHK 6 A . 10 HHK o 1 6425 6 1 1 1 11 SER 6 A . 11 SER . 1 6425 6 1 1 1 12 CYS 6 A . 12 CYS . 1 6425 6 stop_ save_ save_PB_annotation_7 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 7 _PB_list.Query_ID db1xy8_1425#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1xy8.ent _PB_list.Output_file_name bmr6425_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr6425_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code YCKFEXXTFXSC _PB_list.PB_seq_code zzjafklmcdzz _PB_list.PDB_ID 1XY8 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "Torsion angle dynamics" _PB_list.Entry_ID 6425 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 TYR 7 A . 1 TYR . 1 6425 7 1 1 1 2 CYS 7 A . 2 CYS . 1 6425 7 1 1 1 3 LYS 7 A . 3 LYS j 1 6425 7 1 1 1 4 PHE 7 A . 4 PHE a 1 6425 7 1 1 1 5 GLU 7 A . 5 GLU f 1 6425 7 1 1 1 6 DTR 7 A . 6 DTR k 1 6425 7 1 1 1 7 IAM 7 A . 7 IAM l 1 6425 7 1 1 1 8 THR 7 A . 8 THR m 1 6425 7 1 1 1 9 PHE 7 A . 9 PHE c 1 6425 7 1 1 1 10 HHK 7 A . 10 HHK d 1 6425 7 1 1 1 11 SER 7 A . 11 SER . 1 6425 7 1 1 1 12 CYS 7 A . 12 CYS . 1 6425 7 stop_ save_ save_PB_annotation_8 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 8 _PB_list.Query_ID db1xy8_1425#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1xy8.ent _PB_list.Output_file_name bmr6425_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr6425_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code YCKFEXXTFXSC _PB_list.PB_seq_code zzlafklccdzz _PB_list.PDB_ID 1XY8 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "Torsion angle dynamics" _PB_list.Entry_ID 6425 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 TYR 8 A . 1 TYR . 1 6425 8 1 1 1 2 CYS 8 A . 2 CYS . 1 6425 8 1 1 1 3 LYS 8 A . 3 LYS l 1 6425 8 1 1 1 4 PHE 8 A . 4 PHE a 1 6425 8 1 1 1 5 GLU 8 A . 5 GLU f 1 6425 8 1 1 1 6 DTR 8 A . 6 DTR k 1 6425 8 1 1 1 7 IAM 8 A . 7 IAM l 1 6425 8 1 1 1 8 THR 8 A . 8 THR c 1 6425 8 1 1 1 9 PHE 8 A . 9 PHE c 1 6425 8 1 1 1 10 HHK 8 A . 10 HHK d 1 6425 8 1 1 1 11 SER 8 A . 11 SER . 1 6425 8 1 1 1 12 CYS 8 A . 12 CYS . 1 6425 8 stop_ save_ save_PB_annotation_9 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 9 _PB_list.Query_ID db1xy8_1425#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1xy8.ent _PB_list.Output_file_name bmr6425_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr6425_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code YCKFEXXTFXSC _PB_list.PB_seq_code zznojmbmcezz _PB_list.PDB_ID 1XY8 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "Torsion angle dynamics" _PB_list.Entry_ID 6425 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 TYR 9 A . 1 TYR . 1 6425 9 1 1 1 2 CYS 9 A . 2 CYS . 1 6425 9 1 1 1 3 LYS 9 A . 3 LYS n 1 6425 9 1 1 1 4 PHE 9 A . 4 PHE o 1 6425 9 1 1 1 5 GLU 9 A . 5 GLU j 1 6425 9 1 1 1 6 DTR 9 A . 6 DTR m 1 6425 9 1 1 1 7 IAM 9 A . 7 IAM b 1 6425 9 1 1 1 8 THR 9 A . 8 THR m 1 6425 9 1 1 1 9 PHE 9 A . 9 PHE c 1 6425 9 1 1 1 10 HHK 9 A . 10 HHK e 1 6425 9 1 1 1 11 SER 9 A . 11 SER . 1 6425 9 1 1 1 12 CYS 9 A . 12 CYS . 1 6425 9 stop_ save_ save_PB_annotation_10 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 10 _PB_list.Query_ID db1xy8_1425#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1xy8.ent _PB_list.Output_file_name bmr6425_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr6425_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code YCKFEXXTFXSC _PB_list.PB_seq_code zzlojmlmnozz _PB_list.PDB_ID 1XY8 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "Torsion angle dynamics" _PB_list.Entry_ID 6425 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 TYR 10 A . 1 TYR . 1 6425 10 1 1 1 2 CYS 10 A . 2 CYS . 1 6425 10 1 1 1 3 LYS 10 A . 3 LYS l 1 6425 10 1 1 1 4 PHE 10 A . 4 PHE o 1 6425 10 1 1 1 5 GLU 10 A . 5 GLU j 1 6425 10 1 1 1 6 DTR 10 A . 6 DTR m 1 6425 10 1 1 1 7 IAM 10 A . 7 IAM l 1 6425 10 1 1 1 8 THR 10 A . 8 THR m 1 6425 10 1 1 1 9 PHE 10 A . 9 PHE n 1 6425 10 1 1 1 10 HHK 10 A . 10 HHK o 1 6425 10 1 1 1 11 SER 10 A . 11 SER . 1 6425 10 1 1 1 12 CYS 10 A . 12 CYS . 1 6425 10 stop_ save_