data_PB ############################# # Protein Blocks Annotation # ############################# ####################################################################################### # PB encoding by Protein Blocks Expert 2.0 server (http://www.bo-protscience.fr/pbe/) # # Reference: Biophys Rev. 2010 Aug;2(3):137-147. Epub 2010 Aug 5. # # : Nucleic Acids Res. 2006 Jul 1;34(Web Server issue):W119-23. # ####################################################################################### save_PB_annotation_1 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 1 _PB_list.Query_ID db1cnl_345#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1cnl.ent _PB_list.Output_file_name bmr4399_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr4399_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GCCSDPRCAWRCX _PB_list.PB_seq_code zzlpmklonoxzz _PB_list.PDB_ID 1CNL _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "SIMULATED ANNEALING" _PB_list.Entry_ID 4399 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 GLY 1 A . 1 GLY . 1 4399 1 1 1 1 2 CYS 1 A . 2 CYS . 1 4399 1 1 1 1 3 CYS 1 A . 3 CYS l 1 4399 1 1 1 1 4 SER 1 A . 4 SER p 1 4399 1 1 1 1 5 ASP 1 A . 5 ASP m 1 4399 1 1 1 1 6 PRO 1 A . 6 PRO k 1 4399 1 1 1 1 7 ARG 1 A . 7 ARG l 1 4399 1 1 1 1 8 CYS 1 A . 8 CYS o 1 4399 1 1 1 1 9 ALA 1 A . 9 ALA n 1 4399 1 1 1 1 10 TRP 1 A . 10 TRP o 1 4399 1 1 1 1 11 ARG 1 A . 11 ARG . 1 4399 1 1 1 1 12 CYS 1 A . 12 CYS . 1 4399 1 1 1 1 13 NH2 1 A . 13 NH2 . 1 4399 1 stop_ save_ save_PB_annotation_2 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 2 _PB_list.Query_ID db1cnl_345#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1cnl.ent _PB_list.Output_file_name bmr4399_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr4399_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GCCSDPRCAWRCX _PB_list.PB_seq_code zzlpmklonoxzz _PB_list.PDB_ID 1CNL _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "SIMULATED ANNEALING" _PB_list.Entry_ID 4399 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 GLY 2 A . 1 GLY . 1 4399 2 1 1 1 2 CYS 2 A . 2 CYS . 1 4399 2 1 1 1 3 CYS 2 A . 3 CYS l 1 4399 2 1 1 1 4 SER 2 A . 4 SER p 1 4399 2 1 1 1 5 ASP 2 A . 5 ASP m 1 4399 2 1 1 1 6 PRO 2 A . 6 PRO k 1 4399 2 1 1 1 7 ARG 2 A . 7 ARG l 1 4399 2 1 1 1 8 CYS 2 A . 8 CYS o 1 4399 2 1 1 1 9 ALA 2 A . 9 ALA n 1 4399 2 1 1 1 10 TRP 2 A . 10 TRP o 1 4399 2 1 1 1 11 ARG 2 A . 11 ARG . 1 4399 2 1 1 1 12 CYS 2 A . 12 CYS . 1 4399 2 1 1 1 13 NH2 2 A . 13 NH2 . 1 4399 2 stop_ save_ save_PB_annotation_3 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 3 _PB_list.Query_ID db1cnl_345#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1cnl.ent _PB_list.Output_file_name bmr4399_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr4399_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GCCSDPRCAWRCX _PB_list.PB_seq_code zzlpmklonoxzz _PB_list.PDB_ID 1CNL _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "SIMULATED ANNEALING" _PB_list.Entry_ID 4399 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 GLY 3 A . 1 GLY . 1 4399 3 1 1 1 2 CYS 3 A . 2 CYS . 1 4399 3 1 1 1 3 CYS 3 A . 3 CYS l 1 4399 3 1 1 1 4 SER 3 A . 4 SER p 1 4399 3 1 1 1 5 ASP 3 A . 5 ASP m 1 4399 3 1 1 1 6 PRO 3 A . 6 PRO k 1 4399 3 1 1 1 7 ARG 3 A . 7 ARG l 1 4399 3 1 1 1 8 CYS 3 A . 8 CYS o 1 4399 3 1 1 1 9 ALA 3 A . 9 ALA n 1 4399 3 1 1 1 10 TRP 3 A . 10 TRP o 1 4399 3 1 1 1 11 ARG 3 A . 11 ARG . 1 4399 3 1 1 1 12 CYS 3 A . 12 CYS . 1 4399 3 1 1 1 13 NH2 3 A . 13 NH2 . 1 4399 3 stop_ save_ save_PB_annotation_4 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 4 _PB_list.Query_ID db1cnl_345#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1cnl.ent _PB_list.Output_file_name bmr4399_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr4399_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GCCSDPRCAWRCX _PB_list.PB_seq_code zzlpmklonoxzz _PB_list.PDB_ID 1CNL _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "SIMULATED ANNEALING" _PB_list.Entry_ID 4399 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 GLY 4 A . 1 GLY . 1 4399 4 1 1 1 2 CYS 4 A . 2 CYS . 1 4399 4 1 1 1 3 CYS 4 A . 3 CYS l 1 4399 4 1 1 1 4 SER 4 A . 4 SER p 1 4399 4 1 1 1 5 ASP 4 A . 5 ASP m 1 4399 4 1 1 1 6 PRO 4 A . 6 PRO k 1 4399 4 1 1 1 7 ARG 4 A . 7 ARG l 1 4399 4 1 1 1 8 CYS 4 A . 8 CYS o 1 4399 4 1 1 1 9 ALA 4 A . 9 ALA n 1 4399 4 1 1 1 10 TRP 4 A . 10 TRP o 1 4399 4 1 1 1 11 ARG 4 A . 11 ARG . 1 4399 4 1 1 1 12 CYS 4 A . 12 CYS . 1 4399 4 1 1 1 13 NH2 4 A . 13 NH2 . 1 4399 4 stop_ save_ save_PB_annotation_5 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 5 _PB_list.Query_ID db1cnl_345#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1cnl.ent _PB_list.Output_file_name bmr4399_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr4399_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GCCSDPRCAWRCX _PB_list.PB_seq_code zzlpmklonoxzz _PB_list.PDB_ID 1CNL _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "SIMULATED ANNEALING" _PB_list.Entry_ID 4399 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 GLY 5 A . 1 GLY . 1 4399 5 1 1 1 2 CYS 5 A . 2 CYS . 1 4399 5 1 1 1 3 CYS 5 A . 3 CYS l 1 4399 5 1 1 1 4 SER 5 A . 4 SER p 1 4399 5 1 1 1 5 ASP 5 A . 5 ASP m 1 4399 5 1 1 1 6 PRO 5 A . 6 PRO k 1 4399 5 1 1 1 7 ARG 5 A . 7 ARG l 1 4399 5 1 1 1 8 CYS 5 A . 8 CYS o 1 4399 5 1 1 1 9 ALA 5 A . 9 ALA n 1 4399 5 1 1 1 10 TRP 5 A . 10 TRP o 1 4399 5 1 1 1 11 ARG 5 A . 11 ARG . 1 4399 5 1 1 1 12 CYS 5 A . 12 CYS . 1 4399 5 1 1 1 13 NH2 5 A . 13 NH2 . 1 4399 5 stop_ save_ save_PB_annotation_6 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 6 _PB_list.Query_ID db1cnl_345#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1cnl.ent _PB_list.Output_file_name bmr4399_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr4399_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GCCSDPRCAWRCX _PB_list.PB_seq_code zzlpmklonoxzz _PB_list.PDB_ID 1CNL _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "SIMULATED ANNEALING" _PB_list.Entry_ID 4399 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 GLY 6 A . 1 GLY . 1 4399 6 1 1 1 2 CYS 6 A . 2 CYS . 1 4399 6 1 1 1 3 CYS 6 A . 3 CYS l 1 4399 6 1 1 1 4 SER 6 A . 4 SER p 1 4399 6 1 1 1 5 ASP 6 A . 5 ASP m 1 4399 6 1 1 1 6 PRO 6 A . 6 PRO k 1 4399 6 1 1 1 7 ARG 6 A . 7 ARG l 1 4399 6 1 1 1 8 CYS 6 A . 8 CYS o 1 4399 6 1 1 1 9 ALA 6 A . 9 ALA n 1 4399 6 1 1 1 10 TRP 6 A . 10 TRP o 1 4399 6 1 1 1 11 ARG 6 A . 11 ARG . 1 4399 6 1 1 1 12 CYS 6 A . 12 CYS . 1 4399 6 1 1 1 13 NH2 6 A . 13 NH2 . 1 4399 6 stop_ save_ save_PB_annotation_7 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 7 _PB_list.Query_ID db1cnl_345#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1cnl.ent _PB_list.Output_file_name bmr4399_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr4399_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GCCSDPRCAWRCX _PB_list.PB_seq_code zzlpmklonoxzz _PB_list.PDB_ID 1CNL _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "SIMULATED ANNEALING" _PB_list.Entry_ID 4399 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 GLY 7 A . 1 GLY . 1 4399 7 1 1 1 2 CYS 7 A . 2 CYS . 1 4399 7 1 1 1 3 CYS 7 A . 3 CYS l 1 4399 7 1 1 1 4 SER 7 A . 4 SER p 1 4399 7 1 1 1 5 ASP 7 A . 5 ASP m 1 4399 7 1 1 1 6 PRO 7 A . 6 PRO k 1 4399 7 1 1 1 7 ARG 7 A . 7 ARG l 1 4399 7 1 1 1 8 CYS 7 A . 8 CYS o 1 4399 7 1 1 1 9 ALA 7 A . 9 ALA n 1 4399 7 1 1 1 10 TRP 7 A . 10 TRP o 1 4399 7 1 1 1 11 ARG 7 A . 11 ARG . 1 4399 7 1 1 1 12 CYS 7 A . 12 CYS . 1 4399 7 1 1 1 13 NH2 7 A . 13 NH2 . 1 4399 7 stop_ save_ save_PB_annotation_8 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 8 _PB_list.Query_ID db1cnl_345#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1cnl.ent _PB_list.Output_file_name bmr4399_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr4399_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GCCSDPRCAWRCX _PB_list.PB_seq_code zzlpmklonoxzz _PB_list.PDB_ID 1CNL _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "SIMULATED ANNEALING" _PB_list.Entry_ID 4399 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 GLY 8 A . 1 GLY . 1 4399 8 1 1 1 2 CYS 8 A . 2 CYS . 1 4399 8 1 1 1 3 CYS 8 A . 3 CYS l 1 4399 8 1 1 1 4 SER 8 A . 4 SER p 1 4399 8 1 1 1 5 ASP 8 A . 5 ASP m 1 4399 8 1 1 1 6 PRO 8 A . 6 PRO k 1 4399 8 1 1 1 7 ARG 8 A . 7 ARG l 1 4399 8 1 1 1 8 CYS 8 A . 8 CYS o 1 4399 8 1 1 1 9 ALA 8 A . 9 ALA n 1 4399 8 1 1 1 10 TRP 8 A . 10 TRP o 1 4399 8 1 1 1 11 ARG 8 A . 11 ARG . 1 4399 8 1 1 1 12 CYS 8 A . 12 CYS . 1 4399 8 1 1 1 13 NH2 8 A . 13 NH2 . 1 4399 8 stop_ save_ save_PB_annotation_9 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 9 _PB_list.Query_ID db1cnl_345#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1cnl.ent _PB_list.Output_file_name bmr4399_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr4399_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GCCSDPRCAWRCX _PB_list.PB_seq_code zzlpmklonoxzz _PB_list.PDB_ID 1CNL _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "SIMULATED ANNEALING" _PB_list.Entry_ID 4399 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 GLY 9 A . 1 GLY . 1 4399 9 1 1 1 2 CYS 9 A . 2 CYS . 1 4399 9 1 1 1 3 CYS 9 A . 3 CYS l 1 4399 9 1 1 1 4 SER 9 A . 4 SER p 1 4399 9 1 1 1 5 ASP 9 A . 5 ASP m 1 4399 9 1 1 1 6 PRO 9 A . 6 PRO k 1 4399 9 1 1 1 7 ARG 9 A . 7 ARG l 1 4399 9 1 1 1 8 CYS 9 A . 8 CYS o 1 4399 9 1 1 1 9 ALA 9 A . 9 ALA n 1 4399 9 1 1 1 10 TRP 9 A . 10 TRP o 1 4399 9 1 1 1 11 ARG 9 A . 11 ARG . 1 4399 9 1 1 1 12 CYS 9 A . 12 CYS . 1 4399 9 1 1 1 13 NH2 9 A . 13 NH2 . 1 4399 9 stop_ save_ save_PB_annotation_10 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 10 _PB_list.Query_ID db1cnl_345#A _PB_list.Queried_date 2014-12-15 _PB_list.Input_file_name pdb1cnl.ent _PB_list.Output_file_name bmr4399_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr4399_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GCCSDPRCAWRCX _PB_list.PB_seq_code zzlpmklonoxzz _PB_list.PDB_ID 1CNL _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "SIMULATED ANNEALING" _PB_list.Entry_ID 4399 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 GLY 10 A . 1 GLY . 1 4399 10 1 1 1 2 CYS 10 A . 2 CYS . 1 4399 10 1 1 1 3 CYS 10 A . 3 CYS l 1 4399 10 1 1 1 4 SER 10 A . 4 SER p 1 4399 10 1 1 1 5 ASP 10 A . 5 ASP m 1 4399 10 1 1 1 6 PRO 10 A . 6 PRO k 1 4399 10 1 1 1 7 ARG 10 A . 7 ARG l 1 4399 10 1 1 1 8 CYS 10 A . 8 CYS o 1 4399 10 1 1 1 9 ALA 10 A . 9 ALA n 1 4399 10 1 1 1 10 TRP 10 A . 10 TRP o 1 4399 10 1 1 1 11 ARG 10 A . 11 ARG . 1 4399 10 1 1 1 12 CYS 10 A . 12 CYS . 1 4399 10 1 1 1 13 NH2 10 A . 13 NH2 . 1 4399 10 stop_ save_