data_PB ############################# # Protein Blocks Annotation # ############################# ####################################################################################### # PB encoding by Protein Blocks Expert 2.0 server (http://www.bo-protscience.fr/pbe/) # # Reference: Biophys Rev. 2010 Aug;2(3):137-147. Epub 2010 Aug 5. # # : Nucleic Acids Res. 2006 Jul 1;34(Web Server issue):W119-23. # ####################################################################################### save_PB_annotation_1 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 1 _PB_list.Query_ID db2ksa_5300#B _PB_list.Queried_date 2014-12-16 _PB_list.Input_file_name pdb2ksa.ent _PB_list.Output_file_name bmr20116_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr20116_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code RPKPQQFFGLM _PB_list.PB_seq_code zzfklmmmmzz _PB_list.PDB_ID 2KSA _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "molecular dynamics, simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 20116 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 ARG 1 B . 1 ARG . 1 20116 1 1 1 1 2 PRO 1 B . 2 PRO . 1 20116 1 1 1 1 3 LYS 1 B . 3 LYS f 1 20116 1 1 1 1 4 PRO 1 B . 4 PRO k 1 20116 1 1 1 1 5 GLN 1 B . 5 GLN l 1 20116 1 1 1 1 6 GLN 1 B . 6 GLN m 1 20116 1 1 1 1 7 PHE 1 B . 7 PHE m 1 20116 1 1 1 1 8 PHE 1 B . 8 PHE m 1 20116 1 1 1 1 9 GLY 1 B . 9 GLY m 1 20116 1 1 1 1 10 LEU 1 B . 10 LEU . 1 20116 1 1 1 1 11 MET 1 B . 11 MET . 1 20116 1 stop_ save_ save_PB_annotation_2 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 2 _PB_list.Query_ID db2ksa_5300#B _PB_list.Queried_date 2014-12-16 _PB_list.Input_file_name pdb2ksa.ent _PB_list.Output_file_name bmr20116_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr20116_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code RPKPQQFFGLM _PB_list.PB_seq_code zzfklmmmmzz _PB_list.PDB_ID 2KSA _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "molecular dynamics, simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 20116 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 ARG 2 B . 1 ARG . 1 20116 2 1 1 1 2 PRO 2 B . 2 PRO . 1 20116 2 1 1 1 3 LYS 2 B . 3 LYS f 1 20116 2 1 1 1 4 PRO 2 B . 4 PRO k 1 20116 2 1 1 1 5 GLN 2 B . 5 GLN l 1 20116 2 1 1 1 6 GLN 2 B . 6 GLN m 1 20116 2 1 1 1 7 PHE 2 B . 7 PHE m 1 20116 2 1 1 1 8 PHE 2 B . 8 PHE m 1 20116 2 1 1 1 9 GLY 2 B . 9 GLY m 1 20116 2 1 1 1 10 LEU 2 B . 10 LEU . 1 20116 2 1 1 1 11 MET 2 B . 11 MET . 1 20116 2 stop_ save_ save_PB_annotation_3 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 3 _PB_list.Query_ID db2ksa_5300#B _PB_list.Queried_date 2014-12-16 _PB_list.Input_file_name pdb2ksa.ent _PB_list.Output_file_name bmr20116_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr20116_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code RPKPQQFFGLM _PB_list.PB_seq_code zzfklmmmmzz _PB_list.PDB_ID 2KSA _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "molecular dynamics, simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 20116 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 ARG 3 B . 1 ARG . 1 20116 3 1 1 1 2 PRO 3 B . 2 PRO . 1 20116 3 1 1 1 3 LYS 3 B . 3 LYS f 1 20116 3 1 1 1 4 PRO 3 B . 4 PRO k 1 20116 3 1 1 1 5 GLN 3 B . 5 GLN l 1 20116 3 1 1 1 6 GLN 3 B . 6 GLN m 1 20116 3 1 1 1 7 PHE 3 B . 7 PHE m 1 20116 3 1 1 1 8 PHE 3 B . 8 PHE m 1 20116 3 1 1 1 9 GLY 3 B . 9 GLY m 1 20116 3 1 1 1 10 LEU 3 B . 10 LEU . 1 20116 3 1 1 1 11 MET 3 B . 11 MET . 1 20116 3 stop_ save_ save_PB_annotation_4 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 4 _PB_list.Query_ID db2ksa_5300#B _PB_list.Queried_date 2014-12-16 _PB_list.Input_file_name pdb2ksa.ent _PB_list.Output_file_name bmr20116_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr20116_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code RPKPQQFFGLM _PB_list.PB_seq_code zzfklmmmmzz _PB_list.PDB_ID 2KSA _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "molecular dynamics, simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 20116 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 ARG 4 B . 1 ARG . 1 20116 4 1 1 1 2 PRO 4 B . 2 PRO . 1 20116 4 1 1 1 3 LYS 4 B . 3 LYS f 1 20116 4 1 1 1 4 PRO 4 B . 4 PRO k 1 20116 4 1 1 1 5 GLN 4 B . 5 GLN l 1 20116 4 1 1 1 6 GLN 4 B . 6 GLN m 1 20116 4 1 1 1 7 PHE 4 B . 7 PHE m 1 20116 4 1 1 1 8 PHE 4 B . 8 PHE m 1 20116 4 1 1 1 9 GLY 4 B . 9 GLY m 1 20116 4 1 1 1 10 LEU 4 B . 10 LEU . 1 20116 4 1 1 1 11 MET 4 B . 11 MET . 1 20116 4 stop_ save_ save_PB_annotation_5 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 5 _PB_list.Query_ID db2ksa_5300#B _PB_list.Queried_date 2014-12-16 _PB_list.Input_file_name pdb2ksa.ent _PB_list.Output_file_name bmr20116_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr20116_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code RPKPQQFFGLM _PB_list.PB_seq_code zzfklmmmmzz _PB_list.PDB_ID 2KSA _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "molecular dynamics, simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 20116 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 1 1 1 1 ARG 5 B . 1 ARG . 1 20116 5 1 1 1 2 PRO 5 B . 2 PRO . 1 20116 5 1 1 1 3 LYS 5 B . 3 LYS f 1 20116 5 1 1 1 4 PRO 5 B . 4 PRO k 1 20116 5 1 1 1 5 GLN 5 B . 5 GLN l 1 20116 5 1 1 1 6 GLN 5 B . 6 GLN m 1 20116 5 1 1 1 7 PHE 5 B . 7 PHE m 1 20116 5 1 1 1 8 PHE 5 B . 8 PHE m 1 20116 5 1 1 1 9 GLY 5 B . 9 GLY m 1 20116 5 1 1 1 10 LEU 5 B . 10 LEU . 1 20116 5 1 1 1 11 MET 5 B . 11 MET . 1 20116 5 stop_ save_