data_PB ############################# # Protein Blocks Annotation # ############################# ####################################################################################### # PB encoding by Protein Blocks Expert 2.0 server (http://www.bo-protscience.fr/pbe/) # # Reference: Biophys Rev. 2010 Aug;2(3):137-147. Epub 2010 Aug 5. # # : Nucleic Acids Res. 2006 Jul 1;34(Web Server issue):W119-23. # ####################################################################################### save_PB_annotation_1 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 1 _PB_list.Query_ID db2kdq_10763#A _PB_list.Queried_date 2016-05-02 _PB_list.Input_file_name pdb2kdq.ent _PB_list.Output_file_name bmr16877_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr16877_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code RVRTRKGRRIRIXP _PB_list.PB_seq_code zzdeehiacdehzz _PB_list.PDB_ID 2KDQ _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 16877 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 2 1 2 1 ARG 1 A . 1 ARG . 1 16877 1 2 1 2 2 VAL 1 A . 2 VAL . 1 16877 1 2 1 2 3 ARG 1 A . 3 ARG d 1 16877 1 2 1 2 4 THR 1 A . 4 THR e 1 16877 1 2 1 2 5 ARG 1 A . 5 ARG e 1 16877 1 2 1 2 6 LYS 1 A . 6 LYS h 1 16877 1 2 1 2 7 GLY 1 A . 7 GLY i 1 16877 1 2 1 2 8 ARG 1 A . 8 ARG a 1 16877 1 2 1 2 9 ARG 1 A . 9 ARG c 1 16877 1 2 1 2 10 ILE 1 A . 10 ILE d 1 16877 1 2 1 2 11 ARG 1 A . 11 ARG e 0 16877 1 2 1 2 12 ILE 1 A . 12 ILE h 0 16877 1 2 1 2 13 PRO 1 A . 13 DPR . 0 16877 1 2 1 2 14 PRO 1 A . 14 PRO . 0 16877 1 stop_ save_ save_PB_annotation_2 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 2 _PB_list.Query_ID db2kdq_10763#A _PB_list.Queried_date 2016-05-02 _PB_list.Input_file_name pdb2kdq.ent _PB_list.Output_file_name bmr16877_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr16877_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code RVRTRKGRRIRIXP _PB_list.PB_seq_code zzdeehiacdehzz _PB_list.PDB_ID 2KDQ _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 16877 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 2 1 2 1 ARG 2 A . 1 ARG . 1 16877 2 2 1 2 2 VAL 2 A . 2 VAL . 1 16877 2 2 1 2 3 ARG 2 A . 3 ARG d 1 16877 2 2 1 2 4 THR 2 A . 4 THR e 1 16877 2 2 1 2 5 ARG 2 A . 5 ARG e 1 16877 2 2 1 2 6 LYS 2 A . 6 LYS h 1 16877 2 2 1 2 7 GLY 2 A . 7 GLY i 1 16877 2 2 1 2 8 ARG 2 A . 8 ARG a 1 16877 2 2 1 2 9 ARG 2 A . 9 ARG c 1 16877 2 2 1 2 10 ILE 2 A . 10 ILE d 1 16877 2 2 1 2 11 ARG 2 A . 11 ARG e 0 16877 2 2 1 2 12 ILE 2 A . 12 ILE h 0 16877 2 2 1 2 13 PRO 2 A . 13 DPR . 0 16877 2 2 1 2 14 PRO 2 A . 14 PRO . 0 16877 2 stop_ save_ save_PB_annotation_3 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 3 _PB_list.Query_ID db2kdq_10763#A _PB_list.Queried_date 2016-05-02 _PB_list.Input_file_name pdb2kdq.ent _PB_list.Output_file_name bmr16877_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr16877_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code RVRTRKGRRIRIXP _PB_list.PB_seq_code zzdeehiacdehzz _PB_list.PDB_ID 2KDQ _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 16877 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 2 1 2 1 ARG 3 A . 1 ARG . 1 16877 3 2 1 2 2 VAL 3 A . 2 VAL . 1 16877 3 2 1 2 3 ARG 3 A . 3 ARG d 1 16877 3 2 1 2 4 THR 3 A . 4 THR e 1 16877 3 2 1 2 5 ARG 3 A . 5 ARG e 1 16877 3 2 1 2 6 LYS 3 A . 6 LYS h 1 16877 3 2 1 2 7 GLY 3 A . 7 GLY i 1 16877 3 2 1 2 8 ARG 3 A . 8 ARG a 1 16877 3 2 1 2 9 ARG 3 A . 9 ARG c 1 16877 3 2 1 2 10 ILE 3 A . 10 ILE d 1 16877 3 2 1 2 11 ARG 3 A . 11 ARG e 0 16877 3 2 1 2 12 ILE 3 A . 12 ILE h 0 16877 3 2 1 2 13 PRO 3 A . 13 DPR . 0 16877 3 2 1 2 14 PRO 3 A . 14 PRO . 0 16877 3 stop_ save_ save_PB_annotation_4 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 4 _PB_list.Query_ID db2kdq_10763#A _PB_list.Queried_date 2016-05-02 _PB_list.Input_file_name pdb2kdq.ent _PB_list.Output_file_name bmr16877_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr16877_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code RVRTRKGRRIRIXP _PB_list.PB_seq_code zzdeehiacdehzz _PB_list.PDB_ID 2KDQ _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 16877 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 2 1 2 1 ARG 4 A . 1 ARG . 1 16877 4 2 1 2 2 VAL 4 A . 2 VAL . 1 16877 4 2 1 2 3 ARG 4 A . 3 ARG d 1 16877 4 2 1 2 4 THR 4 A . 4 THR e 1 16877 4 2 1 2 5 ARG 4 A . 5 ARG e 1 16877 4 2 1 2 6 LYS 4 A . 6 LYS h 1 16877 4 2 1 2 7 GLY 4 A . 7 GLY i 1 16877 4 2 1 2 8 ARG 4 A . 8 ARG a 1 16877 4 2 1 2 9 ARG 4 A . 9 ARG c 1 16877 4 2 1 2 10 ILE 4 A . 10 ILE d 1 16877 4 2 1 2 11 ARG 4 A . 11 ARG e 0 16877 4 2 1 2 12 ILE 4 A . 12 ILE h 0 16877 4 2 1 2 13 PRO 4 A . 13 DPR . 0 16877 4 2 1 2 14 PRO 4 A . 14 PRO . 0 16877 4 stop_ save_ save_PB_annotation_5 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 5 _PB_list.Query_ID db2kdq_10763#A _PB_list.Queried_date 2016-05-02 _PB_list.Input_file_name pdb2kdq.ent _PB_list.Output_file_name bmr16877_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr16877_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code RVRTRKGRRIRIXP _PB_list.PB_seq_code zzdeehiacdehzz _PB_list.PDB_ID 2KDQ _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 16877 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 2 1 2 1 ARG 5 A . 1 ARG . 1 16877 5 2 1 2 2 VAL 5 A . 2 VAL . 1 16877 5 2 1 2 3 ARG 5 A . 3 ARG d 1 16877 5 2 1 2 4 THR 5 A . 4 THR e 1 16877 5 2 1 2 5 ARG 5 A . 5 ARG e 1 16877 5 2 1 2 6 LYS 5 A . 6 LYS h 1 16877 5 2 1 2 7 GLY 5 A . 7 GLY i 1 16877 5 2 1 2 8 ARG 5 A . 8 ARG a 1 16877 5 2 1 2 9 ARG 5 A . 9 ARG c 1 16877 5 2 1 2 10 ILE 5 A . 10 ILE d 1 16877 5 2 1 2 11 ARG 5 A . 11 ARG e 0 16877 5 2 1 2 12 ILE 5 A . 12 ILE h 0 16877 5 2 1 2 13 PRO 5 A . 13 DPR . 0 16877 5 2 1 2 14 PRO 5 A . 14 PRO . 0 16877 5 stop_ save_ save_PB_annotation_6 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 6 _PB_list.Query_ID db2kdq_10763#A _PB_list.Queried_date 2016-05-02 _PB_list.Input_file_name pdb2kdq.ent _PB_list.Output_file_name bmr16877_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr16877_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code RVRTRKGRRIRIXP _PB_list.PB_seq_code zzdeehiacdehzz _PB_list.PDB_ID 2KDQ _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 16877 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 2 1 2 1 ARG 6 A . 1 ARG . 1 16877 6 2 1 2 2 VAL 6 A . 2 VAL . 1 16877 6 2 1 2 3 ARG 6 A . 3 ARG d 1 16877 6 2 1 2 4 THR 6 A . 4 THR e 1 16877 6 2 1 2 5 ARG 6 A . 5 ARG e 1 16877 6 2 1 2 6 LYS 6 A . 6 LYS h 1 16877 6 2 1 2 7 GLY 6 A . 7 GLY i 1 16877 6 2 1 2 8 ARG 6 A . 8 ARG a 1 16877 6 2 1 2 9 ARG 6 A . 9 ARG c 1 16877 6 2 1 2 10 ILE 6 A . 10 ILE d 1 16877 6 2 1 2 11 ARG 6 A . 11 ARG e 0 16877 6 2 1 2 12 ILE 6 A . 12 ILE h 0 16877 6 2 1 2 13 PRO 6 A . 13 DPR . 0 16877 6 2 1 2 14 PRO 6 A . 14 PRO . 0 16877 6 stop_ save_ save_PB_annotation_7 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 7 _PB_list.Query_ID db2kdq_10763#A _PB_list.Queried_date 2016-05-02 _PB_list.Input_file_name pdb2kdq.ent _PB_list.Output_file_name bmr16877_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr16877_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code RVRTRKGRRIRIXP _PB_list.PB_seq_code zzdeehiacdehzz _PB_list.PDB_ID 2KDQ _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 16877 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 2 1 2 1 ARG 7 A . 1 ARG . 1 16877 7 2 1 2 2 VAL 7 A . 2 VAL . 1 16877 7 2 1 2 3 ARG 7 A . 3 ARG d 1 16877 7 2 1 2 4 THR 7 A . 4 THR e 1 16877 7 2 1 2 5 ARG 7 A . 5 ARG e 1 16877 7 2 1 2 6 LYS 7 A . 6 LYS h 1 16877 7 2 1 2 7 GLY 7 A . 7 GLY i 1 16877 7 2 1 2 8 ARG 7 A . 8 ARG a 1 16877 7 2 1 2 9 ARG 7 A . 9 ARG c 1 16877 7 2 1 2 10 ILE 7 A . 10 ILE d 1 16877 7 2 1 2 11 ARG 7 A . 11 ARG e 0 16877 7 2 1 2 12 ILE 7 A . 12 ILE h 0 16877 7 2 1 2 13 PRO 7 A . 13 DPR . 0 16877 7 2 1 2 14 PRO 7 A . 14 PRO . 0 16877 7 stop_ save_ save_PB_annotation_8 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 8 _PB_list.Query_ID db2kdq_10763#A _PB_list.Queried_date 2016-05-02 _PB_list.Input_file_name pdb2kdq.ent _PB_list.Output_file_name bmr16877_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr16877_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code RVRTRKGRRIRIXP _PB_list.PB_seq_code zzdeehiacdehzz _PB_list.PDB_ID 2KDQ _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 16877 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 2 1 2 1 ARG 8 A . 1 ARG . 1 16877 8 2 1 2 2 VAL 8 A . 2 VAL . 1 16877 8 2 1 2 3 ARG 8 A . 3 ARG d 1 16877 8 2 1 2 4 THR 8 A . 4 THR e 1 16877 8 2 1 2 5 ARG 8 A . 5 ARG e 1 16877 8 2 1 2 6 LYS 8 A . 6 LYS h 1 16877 8 2 1 2 7 GLY 8 A . 7 GLY i 1 16877 8 2 1 2 8 ARG 8 A . 8 ARG a 1 16877 8 2 1 2 9 ARG 8 A . 9 ARG c 1 16877 8 2 1 2 10 ILE 8 A . 10 ILE d 1 16877 8 2 1 2 11 ARG 8 A . 11 ARG e 0 16877 8 2 1 2 12 ILE 8 A . 12 ILE h 0 16877 8 2 1 2 13 PRO 8 A . 13 DPR . 0 16877 8 2 1 2 14 PRO 8 A . 14 PRO . 0 16877 8 stop_ save_ save_PB_annotation_9 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 9 _PB_list.Query_ID db2kdq_10763#A _PB_list.Queried_date 2016-05-02 _PB_list.Input_file_name pdb2kdq.ent _PB_list.Output_file_name bmr16877_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr16877_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code RVRTRKGRRIRIXP _PB_list.PB_seq_code zzdeehiacdehzz _PB_list.PDB_ID 2KDQ _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 16877 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 2 1 2 1 ARG 9 A . 1 ARG . 1 16877 9 2 1 2 2 VAL 9 A . 2 VAL . 1 16877 9 2 1 2 3 ARG 9 A . 3 ARG d 1 16877 9 2 1 2 4 THR 9 A . 4 THR e 1 16877 9 2 1 2 5 ARG 9 A . 5 ARG e 1 16877 9 2 1 2 6 LYS 9 A . 6 LYS h 1 16877 9 2 1 2 7 GLY 9 A . 7 GLY i 1 16877 9 2 1 2 8 ARG 9 A . 8 ARG a 1 16877 9 2 1 2 9 ARG 9 A . 9 ARG c 1 16877 9 2 1 2 10 ILE 9 A . 10 ILE d 1 16877 9 2 1 2 11 ARG 9 A . 11 ARG e 0 16877 9 2 1 2 12 ILE 9 A . 12 ILE h 0 16877 9 2 1 2 13 PRO 9 A . 13 DPR . 0 16877 9 2 1 2 14 PRO 9 A . 14 PRO . 0 16877 9 stop_ save_ save_PB_annotation_10 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 10 _PB_list.Query_ID db2kdq_10763#A _PB_list.Queried_date 2016-05-02 _PB_list.Input_file_name pdb2kdq.ent _PB_list.Output_file_name bmr16877_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr16877_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code RVRTRKGRRIRIXP _PB_list.PB_seq_code zzdeehiacdehzz _PB_list.PDB_ID 2KDQ _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 16877 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 2 1 2 1 ARG 10 A . 1 ARG . 1 16877 10 2 1 2 2 VAL 10 A . 2 VAL . 1 16877 10 2 1 2 3 ARG 10 A . 3 ARG d 1 16877 10 2 1 2 4 THR 10 A . 4 THR e 1 16877 10 2 1 2 5 ARG 10 A . 5 ARG e 1 16877 10 2 1 2 6 LYS 10 A . 6 LYS h 1 16877 10 2 1 2 7 GLY 10 A . 7 GLY i 1 16877 10 2 1 2 8 ARG 10 A . 8 ARG a 1 16877 10 2 1 2 9 ARG 10 A . 9 ARG c 1 16877 10 2 1 2 10 ILE 10 A . 10 ILE d 1 16877 10 2 1 2 11 ARG 10 A . 11 ARG e 0 16877 10 2 1 2 12 ILE 10 A . 12 ILE h 0 16877 10 2 1 2 13 PRO 10 A . 13 DPR . 0 16877 10 2 1 2 14 PRO 10 A . 14 PRO . 0 16877 10 stop_ save_