data_PB ############################# # Protein Blocks Annotation # ############################# ####################################################################################### # PB encoding by Protein Blocks Expert 2.0 server (http://www.bo-protscience.fr/pbe/) # # Reference: Biophys Rev. 2010 Aug;2(3):137-147. Epub 2010 Aug 5. # # : Nucleic Acids Res. 2006 Jul 1;34(Web Server issue):W119-23. # ####################################################################################### save_PB_annotation_1 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 1 _PB_list.Query_ID db2ru7_2555#C _PB_list.Queried_date 2014-12-16 _PB_list.Input_file_name pdb2ru7.ent _PB_list.Output_file_name bmr11489_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr11489_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GQWNKPSKPKTN _PB_list.PB_seq_code zzehhiafklzz _PB_list.PDB_ID 2RU7 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "energy minimization, simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 11489 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 3 1 2 1 GLY 1 C . 1 GLY . 1 11489 1 3 1 2 2 GLN 1 C . 2 GLN . 1 11489 1 3 1 2 3 TRP 1 C . 3 TRP e 1 11489 1 3 1 2 4 ASN 1 C . 4 ASN h 1 11489 1 3 1 2 5 LYS 1 C . 5 LYS h 1 11489 1 3 1 2 6 PRO 1 C . 6 PRO i 1 11489 1 3 1 2 7 SER 1 C . 7 SER a 1 11489 1 3 1 2 8 LYS 1 C . 8 LYS f 1 11489 1 3 1 2 9 PRO 1 C . 9 PRO k 1 11489 1 3 1 2 10 LYS 1 C . 10 LYS l 1 11489 1 3 1 2 11 THR 1 C . 11 THR . 1 11489 1 3 1 2 12 ASN 1 C . 12 ASN . 1 11489 1 stop_ save_ save_PB_annotation_2 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 2 _PB_list.Query_ID db2ru7_2555#D _PB_list.Queried_date 2014-12-16 _PB_list.Input_file_name pdb2ru7.ent _PB_list.Output_file_name bmr11489_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr11489_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GQWNKPSKPKTN _PB_list.PB_seq_code zzkoopafklzz _PB_list.PDB_ID 2RU7 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "energy minimization, simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 11489 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 3 1 2 1 GLY 1 D . 1 GLY . 1 11489 2 3 1 2 2 GLN 1 D . 2 GLN . 1 11489 2 3 1 2 3 TRP 1 D . 3 TRP k 1 11489 2 3 1 2 4 ASN 1 D . 4 ASN o 1 11489 2 3 1 2 5 LYS 1 D . 5 LYS o 1 11489 2 3 1 2 6 PRO 1 D . 6 PRO p 1 11489 2 3 1 2 7 SER 1 D . 7 SER a 1 11489 2 3 1 2 8 LYS 1 D . 8 LYS f 1 11489 2 3 1 2 9 PRO 1 D . 9 PRO k 1 11489 2 3 1 2 10 LYS 1 D . 10 LYS l 1 11489 2 3 1 2 11 THR 1 D . 11 THR . 1 11489 2 3 1 2 12 ASN 1 D . 12 ASN . 1 11489 2 stop_ save_ save_PB_annotation_3 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 3 _PB_list.Query_ID db2ru7_2555#C _PB_list.Queried_date 2014-12-16 _PB_list.Input_file_name pdb2ru7.ent _PB_list.Output_file_name bmr11489_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr11489_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GQWNKPSKPKTN _PB_list.PB_seq_code zzloonomnozz _PB_list.PDB_ID 2RU7 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "energy minimization, simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 11489 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 3 1 2 1 GLY 2 C . 1 GLY . 1 11489 3 3 1 2 2 GLN 2 C . 2 GLN . 1 11489 3 3 1 2 3 TRP 2 C . 3 TRP l 1 11489 3 3 1 2 4 ASN 2 C . 4 ASN o 1 11489 3 3 1 2 5 LYS 2 C . 5 LYS o 1 11489 3 3 1 2 6 PRO 2 C . 6 PRO n 1 11489 3 3 1 2 7 SER 2 C . 7 SER o 1 11489 3 3 1 2 8 LYS 2 C . 8 LYS m 1 11489 3 3 1 2 9 PRO 2 C . 9 PRO n 1 11489 3 3 1 2 10 LYS 2 C . 10 LYS o 1 11489 3 3 1 2 11 THR 2 C . 11 THR . 1 11489 3 3 1 2 12 ASN 2 C . 12 ASN . 1 11489 3 stop_ save_ save_PB_annotation_4 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 4 _PB_list.Query_ID db2ru7_2555#D _PB_list.Queried_date 2014-12-16 _PB_list.Input_file_name pdb2ru7.ent _PB_list.Output_file_name bmr11489_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr11489_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GQWNKPSKPKTN _PB_list.PB_seq_code zzkoopafklzz _PB_list.PDB_ID 2RU7 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "energy minimization, simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 11489 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 3 1 2 1 GLY 2 D . 1 GLY . 1 11489 4 3 1 2 2 GLN 2 D . 2 GLN . 1 11489 4 3 1 2 3 TRP 2 D . 3 TRP k 1 11489 4 3 1 2 4 ASN 2 D . 4 ASN o 1 11489 4 3 1 2 5 LYS 2 D . 5 LYS o 1 11489 4 3 1 2 6 PRO 2 D . 6 PRO p 1 11489 4 3 1 2 7 SER 2 D . 7 SER a 1 11489 4 3 1 2 8 LYS 2 D . 8 LYS f 1 11489 4 3 1 2 9 PRO 2 D . 9 PRO k 1 11489 4 3 1 2 10 LYS 2 D . 10 LYS l 1 11489 4 3 1 2 11 THR 2 D . 11 THR . 1 11489 4 3 1 2 12 ASN 2 D . 12 ASN . 1 11489 4 stop_ save_ save_PB_annotation_5 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 5 _PB_list.Query_ID db2ru7_2555#C _PB_list.Queried_date 2014-12-16 _PB_list.Input_file_name pdb2ru7.ent _PB_list.Output_file_name bmr11489_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr11489_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GQWNKPSKPKTN _PB_list.PB_seq_code zzehhiafklzz _PB_list.PDB_ID 2RU7 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "energy minimization, simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 11489 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 3 1 2 1 GLY 3 C . 1 GLY . 1 11489 5 3 1 2 2 GLN 3 C . 2 GLN . 1 11489 5 3 1 2 3 TRP 3 C . 3 TRP e 1 11489 5 3 1 2 4 ASN 3 C . 4 ASN h 1 11489 5 3 1 2 5 LYS 3 C . 5 LYS h 1 11489 5 3 1 2 6 PRO 3 C . 6 PRO i 1 11489 5 3 1 2 7 SER 3 C . 7 SER a 1 11489 5 3 1 2 8 LYS 3 C . 8 LYS f 1 11489 5 3 1 2 9 PRO 3 C . 9 PRO k 1 11489 5 3 1 2 10 LYS 3 C . 10 LYS l 1 11489 5 3 1 2 11 THR 3 C . 11 THR . 1 11489 5 3 1 2 12 ASN 3 C . 12 ASN . 1 11489 5 stop_ save_ save_PB_annotation_6 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 6 _PB_list.Query_ID db2ru7_2555#D _PB_list.Queried_date 2014-12-16 _PB_list.Input_file_name pdb2ru7.ent _PB_list.Output_file_name bmr11489_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr11489_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GQWNKPSKPKTN _PB_list.PB_seq_code zzkoopafklzz _PB_list.PDB_ID 2RU7 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "energy minimization, simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 11489 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 3 1 2 1 GLY 3 D . 1 GLY . 1 11489 6 3 1 2 2 GLN 3 D . 2 GLN . 1 11489 6 3 1 2 3 TRP 3 D . 3 TRP k 1 11489 6 3 1 2 4 ASN 3 D . 4 ASN o 1 11489 6 3 1 2 5 LYS 3 D . 5 LYS o 1 11489 6 3 1 2 6 PRO 3 D . 6 PRO p 1 11489 6 3 1 2 7 SER 3 D . 7 SER a 1 11489 6 3 1 2 8 LYS 3 D . 8 LYS f 1 11489 6 3 1 2 9 PRO 3 D . 9 PRO k 1 11489 6 3 1 2 10 LYS 3 D . 10 LYS l 1 11489 6 3 1 2 11 THR 3 D . 11 THR . 1 11489 6 3 1 2 12 ASN 3 D . 12 ASN . 1 11489 6 stop_ save_ save_PB_annotation_7 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 7 _PB_list.Query_ID db2ru7_2555#C _PB_list.Queried_date 2014-12-16 _PB_list.Input_file_name pdb2ru7.ent _PB_list.Output_file_name bmr11489_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr11489_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GQWNKPSKPKTN _PB_list.PB_seq_code zzkoopafklzz _PB_list.PDB_ID 2RU7 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "energy minimization, simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 11489 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 3 1 2 1 GLY 4 C . 1 GLY . 1 11489 7 3 1 2 2 GLN 4 C . 2 GLN . 1 11489 7 3 1 2 3 TRP 4 C . 3 TRP k 1 11489 7 3 1 2 4 ASN 4 C . 4 ASN o 1 11489 7 3 1 2 5 LYS 4 C . 5 LYS o 1 11489 7 3 1 2 6 PRO 4 C . 6 PRO p 1 11489 7 3 1 2 7 SER 4 C . 7 SER a 1 11489 7 3 1 2 8 LYS 4 C . 8 LYS f 1 11489 7 3 1 2 9 PRO 4 C . 9 PRO k 1 11489 7 3 1 2 10 LYS 4 C . 10 LYS l 1 11489 7 3 1 2 11 THR 4 C . 11 THR . 1 11489 7 3 1 2 12 ASN 4 C . 12 ASN . 1 11489 7 stop_ save_ save_PB_annotation_8 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 8 _PB_list.Query_ID db2ru7_2555#D _PB_list.Queried_date 2014-12-16 _PB_list.Input_file_name pdb2ru7.ent _PB_list.Output_file_name bmr11489_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr11489_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GQWNKPSKPKTN _PB_list.PB_seq_code zzkoopafkozz _PB_list.PDB_ID 2RU7 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "energy minimization, simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 11489 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 3 1 2 1 GLY 4 D . 1 GLY . 1 11489 8 3 1 2 2 GLN 4 D . 2 GLN . 1 11489 8 3 1 2 3 TRP 4 D . 3 TRP k 1 11489 8 3 1 2 4 ASN 4 D . 4 ASN o 1 11489 8 3 1 2 5 LYS 4 D . 5 LYS o 1 11489 8 3 1 2 6 PRO 4 D . 6 PRO p 1 11489 8 3 1 2 7 SER 4 D . 7 SER a 1 11489 8 3 1 2 8 LYS 4 D . 8 LYS f 1 11489 8 3 1 2 9 PRO 4 D . 9 PRO k 1 11489 8 3 1 2 10 LYS 4 D . 10 LYS o 1 11489 8 3 1 2 11 THR 4 D . 11 THR . 1 11489 8 3 1 2 12 ASN 4 D . 12 ASN . 1 11489 8 stop_ save_ save_PB_annotation_9 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 9 _PB_list.Query_ID db2ru7_2555#C _PB_list.Queried_date 2014-12-16 _PB_list.Input_file_name pdb2ru7.ent _PB_list.Output_file_name bmr11489_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr11489_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GQWNKPSKPKTN _PB_list.PB_seq_code zzkoopafklzz _PB_list.PDB_ID 2RU7 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "energy minimization, simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 11489 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 3 1 2 1 GLY 5 C . 1 GLY . 1 11489 9 3 1 2 2 GLN 5 C . 2 GLN . 1 11489 9 3 1 2 3 TRP 5 C . 3 TRP k 1 11489 9 3 1 2 4 ASN 5 C . 4 ASN o 1 11489 9 3 1 2 5 LYS 5 C . 5 LYS o 1 11489 9 3 1 2 6 PRO 5 C . 6 PRO p 1 11489 9 3 1 2 7 SER 5 C . 7 SER a 1 11489 9 3 1 2 8 LYS 5 C . 8 LYS f 1 11489 9 3 1 2 9 PRO 5 C . 9 PRO k 1 11489 9 3 1 2 10 LYS 5 C . 10 LYS l 1 11489 9 3 1 2 11 THR 5 C . 11 THR . 1 11489 9 3 1 2 12 ASN 5 C . 12 ASN . 1 11489 9 stop_ save_ save_PB_annotation_10 _PB_list.Sf_category PB_list _PB_list.ID 10 _PB_list.Query_ID db2ru7_2555#D _PB_list.Queried_date 2014-12-16 _PB_list.Input_file_name pdb2ru7.ent _PB_list.Output_file_name bmr11489_PB.str _PB_list.Electronic_address http://bmrbpub.protein.osaka-u.ac.jp/archive/pb/bmr11489_PB.str _PB_list.AA_seq_one_letter_code GQWNKPSKPKTN _PB_list.PB_seq_code zzehhpafklzz _PB_list.PDB_ID 2RU7 _PB_list.PDBX_exptl_method "SOLUTION NMR" _PB_list.PDBX_NMR_refine_method "energy minimization, simulated annealing" _PB_list.Entry_ID 11489 loop_ _PB_char.Entity_assembly_ID _PB_char.Assembly_ID _PB_char.Entity_ID _PB_char.Comp_index_ID _PB_char.Comp_ID _PB_char.PDB_model_num _PB_char.PDB_strand_ID _PB_char.PDB_ins_code _PB_char.PDB_residue_no _PB_char.PDB_residue_name _PB_char.PB_code _PB_char.Align _PB_char.Entry_ID _PB_char.PB_list_ID 3 1 2 1 GLY 5 D . 1 GLY . 1 11489 10 3 1 2 2 GLN 5 D . 2 GLN . 1 11489 10 3 1 2 3 TRP 5 D . 3 TRP e 1 11489 10 3 1 2 4 ASN 5 D . 4 ASN h 1 11489 10 3 1 2 5 LYS 5 D . 5 LYS h 1 11489 10 3 1 2 6 PRO 5 D . 6 PRO p 1 11489 10 3 1 2 7 SER 5 D . 7 SER a 1 11489 10 3 1 2 8 LYS 5 D . 8 LYS f 1 11489 10 3 1 2 9 PRO 5 D . 9 PRO k 1 11489 10 3 1 2 10 LYS 5 D . 10 LYS l 1 11489 10 3 1 2 11 THR 5 D . 11 THR . 1 11489 10 3 1 2 12 ASN 5 D . 12 ASN . 1 11489 10 stop_ save_